El sistema de búsqueda de Modernalia permite al usuario principalmente dos tipologías de localización de recursos. Por un lado, una búsqueda general en el conjunto de la base de datos a través de la introducción de una palabra en el espacio de búsqueda que se ofrece. Por otro lado, una búsqueda avanzada a criterio del usuario, más precisa y detallada, indicando qué buscar en un campo concreto: Título, Materia, Descripción, Audiencia o Destinatario, Cobertura o Cronología, Fuente, etc. Igualmente, en esta opción, se ofrece la posibilidad de buscar por colecciones, intervalo de elementos, etiquetas o exposiciones.